被Diana擊中的Tom生命垂危，NTAC則抓住機會(huì )使用釙元素"凈化"Tom體內的納米機器人。隨后，他們找來(lái)Shawn為T(mén)om療傷，Tom 的命保住了。與此同時(shí)，Shawn的弟弟把七竅流血的媽媽送進(jìn)了醫院。但糟糕的是，凡是靠近他一定距離的人，很多人都會(huì )出現同樣的癥狀，最終倒地死亡－－這是典型的抗Promicin癥狀。原來(lái)，Shawn的弟弟所產(chǎn)生的超能力就是在普通人群中傳播Promicin，速度比流感還快。見(jiàn)到眼前這種恐怖景象，Shawn的弟弟轉身逃進(jìn)了黑夜中。 恢復正常后的Tom為自己做過(guò)的壞事深感自責，Meghan好言勸慰。醫院的情況越來(lái)越嚴重，NTAC下令封鎖了醫院。Shawn的弟弟向Shawn尋求幫助，并承認自己該為媽媽的死負責。悲痛之余，Shawn決定設法阻止這場(chǎng)悲劇。 Isabelle仍然在"印記人"和"預言之城"之間舉棋不定。盡管她不想再做個(gè)壞人，但Rebecca提醒她，她的命掌握在"印記人"手里。 預言之城里，Kyle以領(lǐng)導人的身份發(fā)表電視講話(huà)，表示預言之城可以協(xié)助西雅圖控制局勢。此時(shí)，Promicin瘟疫已經(jīng)蔓延到了醫院之外的地方，甚至包括 NTAC總部，整個(gè)西雅圖陷入一片混亂。Marco對NTAC總部所有活下來(lái)的人（包括Meghan）進(jìn)行了Promicin測試，結果顯示大家都呈陽(yáng)性，唯獨Diana例外－－原來(lái)，在上一季中Kevin對Diana的Promicin實(shí)驗使她產(chǎn)生了抗體。 Meghan眼見(jiàn)形勢失控，決定向預言之城妥協(xié)，并同時(shí)派Diana去4400中心幫助研究Promicin抗體。而Tom聯(lián)想到自己恢復正常的事"印記人"并不知道，決定打入對方內部，以靜制動(dòng)。 Meghan親自來(lái)見(jiàn)Kyle，請求他臨時(shí)幫助維持西雅圖的秩序。她要求Kyle在事情結束后歸還管理權，卻渾然不知自己已經(jīng)成了超能人中的一員。 Rebecca見(jiàn)西雅圖形勢大好，遂命令I(lǐng)sabelle殺死Kyle。Tom若無(wú)其事地走進(jìn)來(lái)，但是Rebecca還是從他的言行舉止中察覺(jué)出了蛛絲馬跡，頓時(shí)起了疑心。 4400中心，Kevin檢查Diana后得出結論，Promicin的抗體并不是稀有的東西，相反，在日常生活中非常普遍。為了贖罪，Shawn 的兄弟不肯接受Shawn和Kevin的方案，不愿意再傷害無(wú)辜的人。最終，為了減輕弟弟的痛苦，Shawn親手殺死了弟弟。接連失去兩位親人， Shawn痛不欲生。 Tom偷偷溜進(jìn)關(guān)押Jordan的房間，兩人達成了一項臨時(shí)性的互助協(xié)議。但是"印記人"的保鏢們很快將他們抓獲。 Isabelle闖進(jìn)預言之城，但是在最后時(shí)刻，她放棄了殺害Kyle。她想Kyle訣別后，返回了"印記人"的老巢。當"印記人"啟動(dòng)她大腦中的破壞裝置后，她忍著(zhù)最后一口氣殺死了Rebecca，救出了Tom和Jordan。 Shawn和Diana召開(kāi)新聞發(fā)布會(huì )，將Kevin對Promicin抗體的研究結果公諸于眾。 Tom將一份"印記人"的名單交給Jordan。因為"印記人"所附身的都是聲名顯赫的人，政府拿他們無(wú)能為力，只有靠Jordan和他的秘密組織來(lái)對付這些人。 八天后，Shawn為母親和兄弟舉行了葬禮。Shawn、Kyle和Tom三個(gè)爭斗了好長(cháng)時(shí)間的親人，終于又聚到了一起。經(jīng)過(guò)此時(shí)事件，西雅圖新增了至少9000名超能人，Jordan Collier的隊伍越發(fā)壯大。Jordan堂而皇之地在市政大廳前的廣場(chǎng)舉行超能人集會(huì )，并邀請媒體到場(chǎng)采訪(fǎng)，宣稱(chēng)新時(shí)代的來(lái)臨。 空無(wú)一人的4400中心，Shawn坐在自己的辦公桌前，盯著(zhù)一本雜志上Jordan Collier的封面照發(fā)呆；NTAC，Meghan手里的筆突然變成了馬蹄蓮，她又驚又喜；Garrity特工發(fā)現自己一分為二，平白無(wú)故多了個(gè)克隆的 "雙胞胎"；Marco發(fā)現自己竟然有了時(shí)空轉換的超能力（如同Heroes中的Hiro）。Maia對Jordan重新掌握局面甚為高興，但Diana 卻憂(yōu)心忡忡。 Kyle回到家中，再次勸說(shuō)父親注射Promicin，并親手將注射器放在他的面前。 高速公路上，原本佇立的"歡迎來(lái)到西雅圖"的標牌，已被超能人改成了"歡迎來(lái)到預言之城"。西雅圖已徹底被超能人掌控。